㈠ 超滤管能用于强碱或强酸溶液的超滤吗
1、选择合适的超滤管,主要考虑MWCO和浓缩体积,最常见的是Ultra-15(10kD)。
通常应截留分子量版不应大于目的蛋白分子量的权1/3,比如目的蛋白分子量为35kDa,就可以选择10kDa截留分子量的超滤管。
若目的蛋白分子量为10kD左右,则可以用截留分子量3kD的超滤管。
认真阅读使用说明书,注意超滤膜对各种化学物质的耐受程度有所不同,表格中有。
2、新买来的超滤是干燥的,使用前加入MilliQ水,水量完全过膜,冰浴或冰箱里预冷几分钟。
然后将水倒出,即可加入蛋白液,加入的多少,以不超过管顶的白线为准。
操作要轻,加入蛋白液前,超滤管需要插在冰上预冷。
3、平衡。
质量和重心二者都要达到平衡。
注意转速和加速度不可太快,否则直接损坏超滤膜。
注意,一定要等离心机达到目的转速之后,方可离开
离心机,否则离心机出问题时,无法第一时间处理,后果不可预测。
膜与转轴的方向根据说明书调整(角转离心机的情况是膜与轴垂直)。
在实际使用中,一般转速开的比说明书里的要低,这样可以延长离心管的使用寿命。
㈡ 超滤离心管怎么使用
蛋白浓缩和换Buffer通常使用的超滤管,常用Millipore的Amicon-Ultra-15超滤管(MWCO10kD)。也有其它型号的、不同体积大小和超滤管可选,视目的蛋白的分子量与浓缩前体积、浓缩目标体积而定。可重复使用。
1、选择合适的超滤管,主要考虑MWCO和浓缩体积,通常应截留分子量不应大于目的蛋白分子量的1/3,比如目的蛋白分子量为35kDa,就可以选择10kDa截留分子量的超滤管。若目的蛋白分子量为10kD左右,则可以用截留分子量3kD的超滤管。
2、新买来的超滤是干燥的,使用前加入MilliQ水,水量完全过膜,冰浴或冰箱里预冷几分钟。然后将水倒出,即可加入蛋白液,加入的多少,以不超过管顶的白线为准。操作要轻,加入蛋白液前,超滤管需要插在冰上预冷。
3、平衡。质量和重心二者都要达到平衡。注意转速和加速度不可太快,否则直接损坏超滤膜。开始离心超滤(离心机预冷至4度)。膜与转轴的方向根据说明书调整(角转离心机的情况是膜与轴垂直)。在实际使用中,一般转速开的比说明书里的要低,这样可以延长离心管的使用寿命。
4、当浓缩到剩下1ml时,【取50ul国产Bradford溶液,加入10ul流穿,看有没变蓝色,以此判断超滤管是否漏掉蛋白。如果管漏了,将上层和流穿重新倒入新管中开始超滤。要精确判断是否漏管,用5mg/ml的BSA离心10min,再取流穿,跑蛋白胶或Bradford粗测】,继续加入剩下的蛋白液浓缩(在冰上操作,防止蛋白受热),直到所有浓缩液都加完为止。离心过程中注意是否发生蛋白沉淀,导致堵管。若发生沉淀,要确定沉淀的具体原因,是蛋白浓度过高还是Buffer不合适;前者可用多根超滤管同时超滤,降低浓度的办法解决,后者的方法是换不同的Buffer,直到蛋白不发生沉淀为止。
5、前面几步用以浓缩蛋白,如果要换Buffer,在总蛋白液浓缩至1ml左右的时候,轻轻加入新的Buffer(经0.22um超滤膜超滤),再浓缩至1ml左右,连续三次,最后一次的浓缩终体积根据需要的蛋白浓度而定,一般不多于500ul,也有浓缩至200ul以内的情况。按照每次至少10倍左右的体积浓缩算,三次达到1000倍以上,基本上可以达到换buffer的目的。
6、取出最终蛋白浓缩液的操作在冰上操作,用黄枪头(200ul)取,轻轻顺着边缘插入枪头,轻轻吹打、混匀蛋白液,注意不要碰到超滤膜,然后吸取浓缩液,每次吸接近200ul,直到吸完。管底剩下的最后一点浓缩液不必吸取,否则难度太大,有可能损坏超滤膜。最后加入MilliQ水到超滤管中,没过超滤膜,防止膜失水变干。
7、以下是处理超滤管,重复利用超滤管的步骤。
8、倒出超滤管里的水,用milliQ水轻轻润洗几次,【若管底有可见的蛋白沉淀,可以先加入水,然后用枪头吹打,注意不要碰到膜,吹打至沉淀悬起,然后倒掉,不可用自来水猛冲】然后加入0.2M的NaOH溶液,室温放置20min,期间平衡超滤管。再离心10min。倒出残留的NaOH溶液,将管芯浸入MilliQ水的烧杯(1或2L)中,放置几个小时,再换新的水,放置几个小时,不断稀释NaOH浓度。50ml管和盖子用自来水洗,内壁再用MilliQ水洗干净。
9、取出浸没的管芯,加至接近满的MilliQ水,50ml管也加满MilliQ水,将管芯慢慢放入50ml
离心管,排出部分水,然后盖上盖子,放4度保存,直到下次使用。一般来说,按照上述步骤和注意事项,每根管用三四年不会坏。
㈢ 超滤离心管怎么使用
蛋白浓缩和换Buffer通常使用的超滤管,常用Millipore的Amicon-Ultra-15超滤管(MWCO10kD)。也有其它型号的、不同体积大小和MWCO超滤管可选,视目的蛋白的分子量与浓缩前体积、浓缩目标体积而定。可重复使用。
1、选择合适的超滤管,主要考虑MWCO和浓缩体积,通常应截留分子量不应大于目的蛋白分子量的1/3,比如目的蛋白分子量为35kDa,就可以选择10kDa截留分子量的超滤管。若目的蛋白分子量为10kD左右,则可以用截留分子量3kD的超滤管。
2、新买来的超滤是干燥的,使用前加入MilliQ水,水量完全过膜,冰浴或冰箱里预冷几分钟。然后将水倒出,即可加入蛋白液,加入的多少,以不超过管顶的白线为准。操作要轻,加入蛋白液前,超滤管需要插在冰上预冷。
3、平衡。质量和重心二者都要达到平衡。注意转速和加速度不可太快,否则直接损坏超滤膜。开始离心超滤(离心机预冷至4度)。膜与转轴的方向根据说明书调整(角转离心机的情况是膜与轴垂直)。在实际使用中,一般转速开的比说明书里的要低,这样可以延长离心管的使用寿命。
4、当浓缩到剩下1ml时,【取50ul国产Bradford溶液,加入10ul流穿,看有没变蓝色,以此判断超滤管是否漏掉蛋白。如果管漏了,将上层和流穿重新倒入新管中开始超滤。要精确判断是否漏管,用5mg/ml的BSA离心10min,再取流穿,跑蛋白胶或Bradford粗测】,继续加入剩下的蛋白液浓缩(在冰上操作,防止蛋白受热),直到所有浓缩液都加完为止。离心过程中注意是否发生蛋白沉淀,导致堵管。若发生沉淀,要确定沉淀的具体原因,是蛋白浓度过高还是Buffer不合适;前者可用多根超滤管同时超滤,降低浓度的办法解决,后者的方法是换不同的Buffer,直到蛋白不发生沉淀为止。
5、前面几步用以浓缩蛋白,如果要换Buffer,在总蛋白液浓缩至1ml左右的时候,轻轻加入新的Buffer(经0.22um超滤膜超滤),再浓缩至1ml左右,连续三次,最后一次的浓缩终体积根据需要的蛋白浓度而定,一般不多于500ul,也有浓缩至200ul以内的情况。按照每次至少10倍左右的体积浓缩算,三次达到1000倍以上,基本上可以达到换buffer的目的。
6、取出最终蛋白浓缩液的操作在冰上操作,用黄枪头(200ul)取,轻轻顺着边缘插入枪头,轻轻吹打、混匀蛋白液,注意不要碰到超滤膜,然后吸取浓缩液,每次吸接近200ul,直到吸完。管底剩下的最后一点浓缩液不必吸取,否则难度太大,有可能损坏超滤膜。最后加入MilliQ水到超滤管中,没过超滤膜,防止膜失水变干。
7、以下是处理超滤管,重复利用超滤管的步骤。
8、倒出超滤管里的水,用milliQ水轻轻润洗几次,【若管底有可见的蛋白沉淀,可以先加入水,然后用枪头吹打,注意不要碰到膜,吹打至沉淀悬起,然后倒掉,不可用自来水猛冲】然后加入0.2M的NaOH溶液,室温放置20min,期间平衡超滤管。再离心10min。倒出残留的NaOH溶液,将管芯浸入MilliQ水的烧杯(1或2L)中,放置几个小时,再换新的水,放置几个小时,不断稀释NaOH浓度。50ml管和盖子用自来水洗,内壁再用MilliQ水洗干净。
9、取出浸没的管芯,加至接近满的MilliQ水,50ml管也加满MilliQ水,将管芯慢慢放入50ml
离心管,排出部分水,然后盖上盖子,放4度保存,直到下次使用。一般来说,按照上述步骤和注意事项,每根管用三四年不会坏。
㈣ 15ml,10kd超滤管转速要多大
1、选择合适的超滤管,主要考虑MWCO和浓缩体积,最常见的是Ultra-15(10kD)。
通常应截版留分子量不应大于权目的蛋白分子量的1/3,比如目的蛋白分子量为35kDa,就可以选择10kDa截留分子量的超滤管。
若目的蛋白分子量为10kD左右,则可以用截留分子量3kD的超滤管。认真阅读使用说明书,注意超滤膜对各种化学物质的耐受程度有所不同,表格中有。
2、新买来的超滤是干燥的,使用前加入MilliQ水,水量完全过膜,冰浴或冰箱里预冷几分钟。然后将水倒出,即可加入蛋白液,加入的多少,以不超过管顶的白线为准。操作要轻,加入蛋白液前,超滤管需要插在冰上预冷。
3、平衡。质量和重心二者都要达到平衡。注意转速和加速度不可太快,否则直接损坏超滤膜。
注意,一定要等离心机达到目的转速之后,方可离开
离心机,否则离心机出问题时,无法第一时间处理,后果不可预测!膜与转轴的方向根据说明书调整(角转离心机的情况是膜与轴垂直)。在实际使用中,一般转速开的比说明书里的要低,这样可以延长离心管的使用寿命。
㈤ 如何处理样品垫才能使全血分离的更好
材料与方法
1.1 血清采集 MG患者全血来自2004~2005年就诊于辽宁中医学院附属医院的门诊患者。根据典型临床表现、新斯的明试验、低频重复电刺激及单纤维肌电图等确诊,无其他自身免疫性疾病,未经其他免疫抑制治疗,并参照1994年版《中医病证诊断疗效标准》辨证为脾肾虚型。正常人血清取自同时期健康志愿者。-70 ℃冰箱冷冻保存备用。
1.2 主要试剂 固相pH梯度干胶条IPG strip(Amersham公司产品, 非线性pH 3~10, 7 cm)。3-〔3-(胆酰胺基丙基)二甲氨基〕丙磺酸盐{3-〔(3-cholamidopropyl) dimethylamino〕-1-propanesul-fonate, CHAPS},二硫苏糖醇(DL-dithiothreitol, DTT),三丁基膦(tributyl phosphine, TBP),尿素,硫脲,碘乙酰胺(iodoacetamide, IAA),丙烯酰胺(acrylamide)、甲双丙烯酰胺(N, N'-methylenebi-sacrylamide),四甲基乙二胺(N, N, N, N-tetram-ethyl-ethylenediamine, TEMED),过硫酰胺(am-monium persulfate, APS),三羟甲基氨基甲烷〔tris (hydroxymethyl) aminomethane〕、甘氨酸(glycine, Gly)和十二烷基磺酸钠(sodium dodecyl sulfate, SDS)均为Bio-Rad公司产品。琼脂糖为华美生物公司产品。其他试剂均使用国产分析纯试剂。所有溶液均用MilliQ水配制。
1.3 主要仪器 高速冷冻离心机,德国Eppendorf公司产品;EttanTMIPGphorⅡ,Amersham Biosci-ences公司产品;P-2000分光光度仪,Hitachi公司产品;SE-600电泳仪,Amersham公司产品;纯水装置,Millipore公司产品;GS-710光密度扫描仪,Bio-Rad公司产品;冷却水循环系统,Cole-Parmer公司产品;Bruker-Daltonics AutoFlex TOF-TOF LIFTMass Spectrometer,美国Bruker-Daltonics公司产品;LCQ Deca XP Plus,美国Thermo Finnigan公司产品。
1.4 双向电泳
1.4.1 血清总蛋白质的提取及定量 血清-70 ℃反复冻融4次后,用Agilent Multiple Affinity Re-moval Column处理去除高丰度蛋白。使用Agilent 5K超滤管进行浓缩除盐,冻干回收的样品,-70 ℃保存。用裂解液(9 mol/L 尿素、4% CHAPS、 65 mmol/L DTT和cocktail酶抑制剂)进行复溶,并采用考马斯亮蓝法进行蛋白质定量。
1.4.2 等电聚焦 自-20 ℃取出的胶条,室温下平衡10 min,以500 μg上样量在每份样本中加入上样缓冲液(8 mol/L尿素、2% CHAPS、1% Bio-lyte和1% TBP)以及标准蛋白质分子,上样于泡胀槽中,加入矿物油覆盖。程序设置如下:30 V 12 h,500 V 1 h,1 000 V 1 h,8 000 V 6 h。恒温20 ℃。等电聚焦电泳后IPG胶条在平衡液1(Tris-base 50 mol/L 、尿素 6 mol/L、甘油 30%、SDS 2%、溴酚蓝0.002%和DTT 100 mg)中于振荡器上振荡 15 min; 然后置入平衡液2(成分同平衡液1,用 400 mg 碘乙酰胺代替100 mg DTT)同样于振荡器上振荡15 min。
1.4.3 SDS-PAGE垂直电泳 采用12.5%的均匀SDS2聚丙烯酰胺凝胶(水23.2 ml,30%丙烯酰胺溶液32.46 ml,1.5 mol/L Tris-HCl缓冲液pH 8.8 20 ml,10% SDS 0.8 ml,10% APS 0.4 ml,TEMED 3.76 μl,胶总体积80 ml)。将平衡后的IPG胶条移至凝胶的上方,胶条一端放入低分子量蛋白质标准,0.5%的琼脂糖封胶。上下槽加入电极缓冲液(Tris 5 mmol/L,Gly 192 mmol/L和SDS 0.1%)。初始电流为每块胶40 mA,电泳20 min,然后以每块胶60 mA电流,直至溴酚蓝前沿。
1.4.4 银染色 电泳结束后,采用硝酸银染色法,通过固定,硝酸银染色,显影,停显及脱色,至背景清晰。
1.5 图像分析 每个样品常规进行3次二维电泳,用GS-710光密度扫描仪对电泳后的胶图分别进行扫描,所得扫描图像输入计算机,采用Image-master软件对图像进行背景消减、蛋白质点检测和校正,获取蛋白质点的位置坐标和表达量等分析。选取 Ratio ≥1.5的蛋白质点认为有差异。所有数据的统计分析均采用SPSS 12.0软件,统计学分析采用 t 检验。
1.6 基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱分析 用手术刀片切下胶上目标条带,进行切胶、胶上胰蛋白酶酶解 20 h ,抽提酶解肽段,Zip Tip脱盐后点样,行基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF-MS)分析(飞行管长2.7 m,加速电压 20 kV ,反射电压23 kV)。将第1级质谱得到的肽片段质量指纹图谱、肽质量指纹图谱与第2级质谱得到的肽序列信息一起用来检索蛋白质数据库,找出匹配的蛋白质。
1.7 数据库检索 将质谱鉴定所得的肽质量指纹谱(peptide mass fingerprinting, PMF)数据于Bio-Works(Thermo Finnigan, San Jose, CA)软件搜索相应的库。搜索使用的数据库为IPI human蛋白库(SEQUEST结果过滤参数为:当Charge+1,Xcorr≥1.9;当Charge+2,Xcorr≥2.2;当Charge+3,Xcorr≥3.75;其中DelCN≥0.1)以及NCBI上 Homo sapiens的非冗余蛋白库(rendant data-base)。检索参数为胰蛋白酶解;氨基酸固定修饰方式为脲甲基半胱氨酸;模式为单同位素峰;肽片断最大误差控制在100 ppm;肽片断最大分子量误差为±0.5 Da;每个肽允许有1个不完全裂解位点。
2 结果
2.1 脾肾虚型重症肌无力患者血清双向电泳图谱 的建立及分析 经2-DE技术及银染色后,得到了两组血清的双向凝胶电泳图,并于相同的条件下重复实验3次。在正常对照组细胞蛋白质组双向电泳图谱上可观察到1 463±179个蛋白点,而脾肾虚型重症肌无力组可见到1 508±89个蛋白点
㈥ 如何用蛋白浓缩管
选择合适的超滤管,主要考虑MWCO和浓缩体积,最常见的是Ultra-15(10kD)。
通常应截留分子量不应大于目的蛋白分子量的1/3,比如目的蛋白分子量为35kDa,就可以选择10kDa截留分子量的超滤管。若目的蛋白分子量为10kD左右,则可以用截留分子量3kD的超滤管。认真阅读使用说明书,注意超滤膜对各种化学物质的耐受程度有所不同。
新买来的超滤是干燥的,使用前加入MilliQ水,水量完全过膜,冰浴或冰箱里预冷几分钟。然后将水倒出,即可加入蛋白液,加入的多少,以不超过管顶的白线为准。操作要轻,加入蛋白液前,超滤管需要插在冰上预冷。
(6)milliq超滤管扩展阅读:
超滤浓缩离心管,最新推出专利产品Hydrosart膜2K型,具有极低的蛋白吸附特性,高流速、高通量,是免疫球蛋白浓缩和脱盐的理想用膜。
备有四种材质的超滤膜:聚醚砜、三醋酸纤维素、再生纤维素和Hydrosart,可根据不同要求灵活选用;两种回收浓缩液的方法:既可用吸管直接吸取并回收,又可将离心管放入离心机反甩,将浓缩液甩入回收帽中,加盖保存。这两种方法都可使浓缩液达到近乎完全回收;
㈦ 蛋白在超滤管浓缩过程中出现沉淀怎么办
1、选择合抄适的超滤管,主要考虑袭MWCO和浓缩体积,最常见的是Ultra-15(10kD)。
通常应截留分子量不应大于目的蛋白分子量的1/3,比如目的蛋白分子量为35kDa,就可以选择10kDa截留分子量的超滤管。
若目的蛋白分子量为10kD左右,则可以用截留分子量3kD的超滤管。认真阅读使用说明书,注意超滤膜对各种化学物质的耐受程度有所不同,表格中有。
2、新买来的超滤是干燥的,使用前加入MilliQ水,水量完全过膜,冰浴或冰箱里预冷几分钟。然后将水倒出,即可加入蛋白液,加入的多少,以不超过管顶的白线为准。操作要轻,加入蛋白液前,超滤管需要插在冰上预冷。
3、平衡。质量和重心二者都要达到平衡。注意转速和加速度不可太快,否则直接损坏超滤膜。
注意,一定要等离心机达到目的转速之后,方可离开
离心机,否则离心机出问题时,无法第一时间处理,后果不可预测!膜与转轴的方向根据说明书调整(角转离心机的情况是膜与轴垂直)。在实际使用中,一般转速开的比说明书里的要低,这样可以延长离心管的使用寿命。
㈧ 全血分离获得血清的方法及步骤 谢谢
材料与方法
1.1 血清采集 MG患者全血来自~2005年就诊于辽宁中医学院附属医院的门诊患者。根据典型临床表现、新斯的明试验、低频重复电刺激及单纤维肌电图等确诊,无其他自身免疫性疾病,未经其他免疫抑制治疗,并参照1994年版《中医病证诊断疗效标准》辨证为脾肾虚型。正常人血清取自同时期健康志愿者。-70 ℃冰箱冷冻保存备用。
1.2 主要试剂 固相pH梯度干胶条IPG strip(Amersham公司产品, 非线性pH 3~10, 7 cm)。3-〔3-(胆酰胺基丙基)二甲氨基〕丙磺酸盐{3-〔(3-cholamidopropyl) dimethylamino〕-1-propanesul-fonate, CHAPS},二硫苏糖醇(DL-dithiothreitol, DTT),三丁基膦(tributyl phosphine, TBP),尿素,硫脲,碘乙酰胺(iodoacetamide, IAA),丙烯酰胺(acrylamide)、甲双丙烯酰胺(N, N'-methylenebi-sacrylamide),四甲基乙二胺(N, N, N, N-tetram-ethyl-ethylenediamine, TEMED),过硫酰胺(am-monium persulfate, APS),三羟甲基氨基甲烷〔tris (hydroxymethyl) aminomethane〕、甘氨酸(glycine, Gly)和十二烷基磺酸钠(sodium dodecyl sulfate, SDS)均为Bio-Rad公司产品。琼脂糖为华美生物公司产品。其他试剂均使用国产分析纯试剂。所有溶液均用MilliQ水配制。
1.3 主要仪器 高速冷冻离心机,德国Eppendorf公司产品;EttanTMIPGphorⅡ,Amersham Biosci-ences公司产品;P-2000分光光度仪,Hitachi公司产品;SE-600电泳仪,Amersham公司产品;纯水装置,Millipore公司产品;GS-710光密度扫描仪,Bio-Rad公司产品;冷却水循环系统,Cole-Parmer公司产品;Bruker-Daltonics AutoFlex TOF-TOF LIFTMass Spectrometer,美国Bruker-Daltonics公司产品;LCQ Deca XP Plus,美国Thermo Finnigan公司产品。
1.4 双向电泳
1.4.1 血清总蛋白质的提取及定量 血清-70 ℃反复冻融4次后,用Agilent Multiple Affinity Re-moval Column处理去除高丰度蛋白。使用Agilent 5K超滤管进行浓缩除盐,冻干回收的样品,-70 ℃保存。用裂解液(9 mol/L 尿素、4% CHAPS、 65 mmol/L DTT和cocktail酶抑制剂)进行复溶,并采用考马斯亮蓝法进行蛋白质定量。
1.4.2 等电聚焦 自-20 ℃取出的胶条,室温下平衡10 min,以500 μg上样量在每份样本中加入上样缓冲液(8 mol/L尿素、2% CHAPS、1% Bio-lyte和1% TBP)以及标准蛋白质分子,上样于泡胀槽中,加入矿物油覆盖。程序设置如下:30 V 12 h,500 V 1 h,1 000 V 1 h,8 000 V 6 h。恒温20 ℃。等电聚焦电泳后IPG胶条在平衡液1(Tris-base 50 mol/L 、尿素 6 mol/L、甘油 30%、SDS 2%、溴酚蓝0.002%和DTT 100 mg)中于振荡器上振荡 15 min; 然后置入平衡液2(成分同平衡液1,用 400 mg 碘乙酰胺代替100 mg DTT)同样于振荡器上振荡15 min。
1.4.3 SDS-PAGE垂直电泳 采用12.5%的均匀SDS2聚丙烯酰胺凝胶(水23.2 ml,30%丙烯酰胺溶液32.46 ml,1.5 mol/L Tris-HCl缓冲液pH 8.8 20 ml,10% SDS 0.8 ml,10% APS 0.4 ml,TEMED 3.76 μl,胶总体积80 ml)。将平衡后的IPG胶条移至凝胶的上方,胶条一端放入低分子量蛋白质标准,0.5%的琼脂糖封胶。上下槽加入电极缓冲液(Tris 5 mmol/L,Gly 192 mmol/L和SDS 0.1%)。初始电流为每块胶40 mA,电泳20 min,然后以每块胶60 mA电流,直至溴酚蓝前沿。
1.4.4 银染色 电泳结束后,采用硝酸银染色法,通过固定,硝酸银染色,显影,停显及脱色,至背景清晰。
1.5 图像分析 每个样品常规进行3次二维电泳,用GS-710光密度扫描仪对电泳后的胶图分别进行扫描,所得扫描图像输入计算机,采用Image-master软件对图像进行背景消减、蛋白质点检测和校正,获取蛋白质点的位置坐标和表达量等分析。选取 Ratio ≥1.5的蛋白质点认为有差异。所有数据的统计分析均采用SPSS 12.0软件,统计学分析采用 t 检验。
1.6 基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱分析 用手术刀片切下胶上目标条带,进行切胶、胶上胰蛋白酶酶解 20 h ,抽提酶解肽段,Zip Tip脱盐后点样,行基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF-MS)分析(飞行管长2.7 m,加速电压 20 kV ,反射电压23 kV)。将第1级质谱得到的肽片段质量指纹图谱、肽质量指纹图谱与第2级质谱得到的肽序列信息一起用来检索蛋白质数据库,找出匹配的蛋白质。
1.7 数据库检索 将质谱鉴定所得的肽质量指纹谱(peptide mass fingerprinting, PMF)数据于Bio-Works(Thermo Finnigan, San Jose, CA)软件搜索相应的库。搜索使用的数据库为IPI human蛋白库(SEQUEST结果过滤参数为:当Charge+1,Xcorr≥1.9;当Charge+2,Xcorr≥2.2;当Charge+3,Xcorr≥3.75;其中DelCN≥0.1)以及NCBI上 Homo sapiens的非冗余蛋白库(rendant data-base)。检索参数为胰蛋白酶解;氨基酸固定修饰方式为脲甲基半胱氨酸;模式为单同位素峰;肽片断最大误差控制在100 ppm;肽片断最大分子量误差为±0.5 Da;每个肽允许有1个不完全裂解位点。
2 结果
2.1 脾肾虚型重症肌无力患者血清双向电泳图谱 的建立及分析 经2-DE技术及银染色后,得到了两组血清的双向凝胶电泳图,并于相同的条件下重复实验3次。在正常对照组细胞蛋白质组双向电泳图谱上可观察到1 463±179个蛋白点,而脾肾虚型重症肌无力组可见到1 508±89个蛋白点
㈨ 超滤浓缩离心管使用前要怎么处理
可能不来同厂家的产品保存运输条源件不一样。
如果有甘油等保护剂,那就一定要洗干净再加样品。
干的超滤管也要先润湿再用,否则可能不能完全利用膜面积。
最好,用样品buffer润洗下再加样,最大程度保证蛋白活性。尤其是用过后保存在NaOH或乙醇中后。
一般还是离心机甩一下好,使膜充分浸润。
降低吸附的办法有:
1,蛋白浓度不要过低
2,尽量选用纤维素的低吸附超滤管
3,用前可以用Tween 80等去垢剂润洗(不影响蛋白活性的前提下)
4,加入保护蛋白,如BSA(不影响蛋白后续使用的前提下)
用完保存在20% EtOH中,4C保存,防止长菌,依不同样品可以重复使用不同的次数。
㈩ 如何用蛋白浓缩管
选择合适的超滤管,主要考虑MWCO和浓缩体积,最常见的是Ultra-15(10kD)。
通常应回截留分子量答不应大于目的蛋白分子量的1/3,比如目的蛋白分子量为35kDa,就可以选择10kDa截留分子量的超滤管。若目的蛋白分子量为10kD左右,则可以用截留分子量3kD的超滤管。认真阅读使用说明书,注意超滤膜对各种化学物质的耐受程度有所不同。
新买来的超滤是干燥的,使用前加入MilliQ水,水量完全过膜,冰浴或冰箱里预冷几分钟。然后将水倒出,即可加入蛋白液,加入的多少,以不超过管顶的白线为准。操作要轻,加入蛋白液前,超滤管需要插在冰上预冷。
(10)milliq超滤管扩展阅读:
超滤浓缩离心管,最新推出专利产品Hydrosart膜2K型,具有极低的蛋白吸附特性,高流速、高通量,是免疫球蛋白浓缩和脱盐的理想用膜。
备有四种材质的超滤膜:聚醚砜、三醋酸纤维素、再生纤维素和Hydrosart,可根据不同要求灵活选用;两种回收浓缩液的方法:既可用吸管直接吸取并回收,又可将离心管放入离心机反甩,将浓缩液甩入回收帽中,加盖保存。这两种方法都可使浓缩液达到近乎完全回收;