1. 怎样利用离子交换柱层析法分离不同的蛋白质
离子交换柱层析法的核心在于不同的蛋白质的等电点不同
所以说，利用版离子交换柱层析法分离不同的权蛋白质其实就是利用不同蛋白质不同的等电点来分离。比如目的蛋白等电点是5，那么在环境pH为8.0的情况下，目的蛋白可以结合阴离子交换层析，而杂蛋白可能不能结合或者结合能力比目的蛋白弱。通过不同的盐浓度的洗脱让结合能力不同的蛋白在不同的组分被洗脱出来，最终完成对目的蛋白和杂蛋白的分离。
2. 凝胶过滤层析和离子交换层析分离蛋白质的原理有何不同
所有的层析在原理上都是相通的，区别在于流动相和层析剂之间的作用力的不同。
离子交换是利用蛋白质表面的电荷与层析剂上的离子基团的静电作用。
凝胶过滤层析利用了凝胶的多孔性，根据溶剂分子的大小进行分离。
3. 离子交换层析法分离纯化蛋白质有哪些局限性
1，离子交换树脂固定床的床层压力会随着分离过程的进程而不断加大，需要重回新填充答。同时，也造成固定床填充过程操作麻烦，而且密封性要求高。2，蛋白质分离纯度问题，如果在出峰之后再行切换接收馏分，而在峰行下降后提前切换，虽可以保证纯度，但蛋白分离收率则会下降。3，由于交换层析介质决定，不同蛋白质相互分离效果也不确定，这种分离，也易造成各蛋白峰重叠，造成分离纯度下降。4，自动化程度不高。主要也是受固定床以及树脂交换饱和当量无法保持长期稳定造成的。无法像液相色谱柱那样，可以在标样标定后，建立方法，自动分离目标蛋白。5，不过，规模化分离纯化蛋白质过程，使用这种层析法，还是具有一定优势的。
………………
……………………
详细资料请参考：
离子交换层析: http://proct.bio1000.com/100474/
4. 离子交换层析法分离纯化蛋白质有哪些局限性
因为抄离子交换吸附蛋白质并不是特异性吸附，在某些情况下可能难以判断结合的蛋白质是否为当初设计的目的蛋白。
离子交换吸附依赖于蛋白质表面的静电荷，如果蛋白质结构比较特殊，可能会有在各种pH都难以结合上离子交换层析的情况。
离子交换层析对于等电点与目标蛋白接近的杂蛋白并没有很好的分离效果。
5. 离子交换层析和亲和层析都可以用来分离所有的蛋白质吗
理论上来说离子交换层析可以用来分离所有的蛋白质，但亲和层析只能内分离能和其特异性结容合或者说带tag的蛋白质。
从实际应用来说，离子交换层析不可能能用来分离所有的蛋白质。这是因为其分辨率没有办法达到分离所有蛋白质。而且蛋白与蛋白之间可能存在其他的相互作用，造成某个盐浓度下被洗脱的蛋白可能会吸附其他蛋白一起被洗脱，达不到分离的效果
亲和层析就更不可能分离所有的蛋白质了，不管是哪种亲和层析都有对应可以特异性吸附的亲和标签蛋白。如果没有亲和标签，所有的蛋白都是不能吸附的
6. 凝胶过滤层析和离子交换层析分离蛋白质的原理有何不同
所有的层析在原理上都是相通的,区别在于流动相和层析剂之间的作用力的回不同.
离子交换是利用答蛋白质表面的电荷与层析剂上的离子基团的静电作用.
凝胶过滤层析利用了凝胶的多孔性,根据溶剂分子的大小进行分离.
7. 离子交换层析法分离纯化蛋白质有哪些局限性
光用一种分离方法想分出纯品是不可能的，离子交换的话得摸清你分离过程蛋白是否易变性。 分离出来稀释倍数也很大。
8. 离子交换层析和亲和层析都可以用来分离所有的蛋白质吗哪种的效果更好
这个你问的太笼统了，方法没有最好的，只有最合适的
蛋白的分离纯化无非是利用版目标蛋白和权别的蛋白不同进行分离，这包括分子量大小，电荷，极性等特性的不同，此外包括别的特性，特别是酶例如酶需要辅酶象苹果酸 脱氢酶，或者底物，酶抑制剂，金属离子等，那相对应的纯化方法有凝胶过滤，离子交换，疏水层析，后面的可以分别把底物，酶抑制剂，金属离子偶联或鳌合到介质上做亲和介质，而象果酸脱氢酶也可以用染料亲和的办法，因为染料的结构和NAD类似。糖蛋白可以用凝集素亲和或者苯硼酸琼脂糖亲和分离等方法，总之要尽 量多知道目标蛋白的特性和了解各种分离的手段，就很容易找到最有效的分离纯化的方法。
9. 离子交换层析在蛋白质分离中的应用
离子交换层析在蛋白质分离纯化中有非常广泛的应用，在样品富集，回中度纯化和精制阶答段都可以采用。另外还可以利用离子交换层析去除DNA和内毒素。因此在生物制品工艺中应用非常广泛。关键是要选择合适的介质和分离条件。
你的问题范围太广，如果有具体的问题可以详细讨论。