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大孔吸附树脂可以提取溶酶菌

发布时间:2022-10-22 05:25:01

Ⅰ 溶菌酶的制备

溶菌酶是采用生物工程技术进行克隆、提取而制取,它是一种天然酶,安全绿色的添加剂,无抗药性。
该酶广泛存在于人体多种组织中,鸟类和家禽的蛋清、哺乳动物的泪、唾液、血浆、尿、乳汁等体液以及微生物中也含此酶,其中以蛋清含量最为丰富。从鸡蛋清中提取分离的溶菌酶是由18种129个氨基酸残基构成的单一肽链。它富含碱性氨基酸,有4对二硫键维持酶构型,是一种碱性蛋白质,其N端为赖氨酸,C端为亮氨酸。可分解溶壁微球菌、巨大芽孢杆菌、黄色八叠球菌等革兰阳性菌。
溶菌酶在等电点以下较广泛的pH值范围内,分子带正电荷,可吸附于弱酸性阳离子交换树脂上,洗脱后盐析,可得溶菌酶沉淀,再进行精制可得成品。蛋清吸附↓724树脂洗涤↓缓冲液洗脱↓硫酸铵溶液盐析透析去碱性蛋白↓NaOH冻干溶菌酶冻干粉沉淀干燥溶菌酶在5~10℃下,将新鲜蛋清540kg加入到已处理好的80kg 724树脂中,搅拌吸附6h,在0~5℃静置过夜。倾出上层蛋清,树脂离心甩干,用蒸馏水反复洗去黏附的卵蛋白,然后将树脂装入柱内,用0?15mol/L、pH=6?5磷酸缓冲溶液约150L洗涤树脂,再用约600L的10%硫酸铵溶液洗脱,收集洗脱液。洗脱液中加硫酸铵,使最终含硫酸铵量为40%,有白色沉淀生成,冷处放置过夜。虹吸上层清液,沉淀吸滤抽干,再用1倍蒸馏水溶解沉淀呈稀糊状,然后装入透析袋,在约5℃的条件下,对蒸馏水透析24h左右,中间换水2~3次。离心去除沉淀,沉淀再用少量水洗一次,洗液与离心液合并。再往透析清液中慢慢加入1mol/L氢氧化钠溶液,同时不断搅拌,使pH值上升到8?0~9?0,如有白色沉淀,即离心除去。然后用3mol/L盐酸调pH=5?0,冷冻干燥,即得白色片状溶菌酶。也可将离心液用3mol/L盐酸调pH=3?5,在搅拌下缓慢加入5%的固体氯化钠,在约5℃的温度下静置48h,离心,沉淀用0℃丙酮洗涤,干燥,即得溶菌酶。

Ⅱ 溶菌酶含量的测定方法

那要看你用什么方法测定dna和rna:
(1)紫外吸收法也就是测量od(260)和od(280)的吸收值,这样的方法其它的杂质对测量结果影响大一点,因为其它杂质在这两个吸收波长也有吸收。
(2)荧光法,用picogreen荧光染料,测定dna,rna浓度比较灵敏,并且适合测量低浓度和微量dna和rna,并且受其它杂质的影响不大,缺点要有专门的荧光检测仪器,试剂比较昂贵。
纯化dna可以买试剂盒,主要有膜吸附法,磁珠分离法,都很方便。

Ⅲ 在溶菌酶的粗提取实验中,为什么将蛋清缓冲液PH调到4.7后又调到8.0

因为卵清蛋白的等电点是4.7,为了提纯溶菌酶,要将卵清蛋白沉淀,所以要把PH调到4.7,至于8.0,这是溶菌酶的最适PH值。

提取溶菌酶的方法:
树脂预处理:干树脂清水浸泡,使其充分膨胀并除去细小颗粒和较大杂质; 1 mol/L 的HCl浸泡2 h,去离子水洗3次至至近中性;抽滤收集树脂,1 mol/L 的NaOH溶液浸泡2 h,去离子水洗3次至近中性;抽滤收集树脂,加0.15 mol/L、pH 值为6.5的磷酸缓冲液平衡过夜待用。
蛋清制备:将3个新鲜鸡蛋洗净干燥,小端敲一个小洞,大端打一个小孔进气,分离得鸡蛋清,用1 mol/L HCl调节PH到7。过滤前称量烧杯重48.7g,缓慢搅拌用灭菌的两层纱布过滤除去脐带块和碎蛋壳等,蛋清与烧杯总重207.5g,蛋清净重158.8g。用1 mol/L 的HCl 溶液调pH 值至7.0,量蛋清体积为100 ml。在调节PH时蛋清中出现少量白色沉淀,可能为部分蛋白由于局部过酸而变性。
吸附:蛋清在不断搅拌下加入抽滤好的724树脂25g(相当蛋清四分之一体积的树脂),冰水浴中磁力搅拌器缓慢搅拌(使树脂全部悬浮在鸡蛋清中,搅拌不能起泡)吸附2.5 h,4℃静置1.5h。然后3000r/min离心15min分层,收集树脂,回收蛋清(留样A)。
去除杂蛋白:收集树脂用去离子水振荡水洗直至洗液澄清(至无白沫为止),吸管轻吸去洗液,以去除杂蛋白。(每洗1次,离心1次,总共3次)冰浴中用等体积的0.15mol/L、pH =6.5的磷酸缓冲液搅拌洗涤15min,抽滤,重复洗三次,注意防止树脂流失。最后一次抽滤滤除树脂水分至干燥。
洗脱溶菌酶:树脂中加入35ml(等体积)的10%(NH4)2SO4溶液搅拌洗脱30 min,抽滤,使溶菌酶从树脂上洗脱下来,重复两次,合并收集洗脱液(留样),洗脱液过滤后,准确量取体积100ml。(留样B)
盐析:每83mL洗脱液加32g磨细的固体(NH4)2SO4,本实验中总量为38.55g。缓慢加入(NH4)2SO4搅拌待完全溶解后保鲜膜封口,置于4℃冰箱盐析过夜。
透析:待白色沉淀析出,3000r/min离心15 min,收集沉淀,用去离子水将沉淀洗下并全部溶解(4.5ml去离子水),装于透析袋中,于去离子水中透析(冰浴),期间2次更换去离子水,直至用BaCl2检测透析完全。透析装置中加入磁子,于磁力搅拌器中搅拌加快透析速度。
去杂质蛋白:取出透析袋中的透析液,用0.1mol/L HCl调整pH4.6,产生少量白色沉淀(留样D),可能为杂蛋白。3000r/min离心10min,收集上清液(留样C 20ul)。
浓缩:用PEG-20000浓缩上清液至1.5ml(留样E,20ul,加loading buffer,出现黄色(可能为浓缩时透析袋中渗入了PEG-20000)。[5][6]

Ⅳ 用大孔树脂,洗脱溶菌酶时用的洗脱剂最适浓度是多少啊,洗脱剂是氯化钠,硫酸铵

实验七 溶菌酶的制备及其性质
D152大孔弱酸性阳离子交换树脂层析:
洗脱:用柱平衡液洗脱杂蛋白,在收集洗脱液的过程中,逐管用紫外分光光度计检验杂蛋白的洗脱情况,当基线开始走平后,改用含1.0mol/L NaCl的pH值6.5,浓度为0.02 mol/L磷酸钠缓冲液洗脱,收集洗脱液。
Sephadex G50分子筛柱层析:
洗脱:样品流完后,先分次加入少量6g/L NaCl洗脱液洗下柱壁上的样品,连接恒流泵,使流速为0.5mL/min,用部分收集器收集,每10分钟一管。

Ⅳ 鸡蛋能提取溶菌酶吗

溶菌酶 溶菌酶(lysozyme)又称胞壁质酶(muramidase)或N-乙酰胞壁质聚糖水解酶(N-acetylmuramide glycanohydrlase),是一种能水解致病菌中黏多糖的碱性酶。主要通过破坏细胞壁中的N-乙酰胞壁酸和N-乙酰氨基葡糖之间的β-1,4糖苷键,使细胞壁不溶性黏多糖分解成可溶性糖肽,导致细胞壁破裂内容物逸出而使细菌溶解。溶菌酶还可与带负电荷的病毒蛋白直接结合,与DNA、RNA、脱辅基蛋白形成复盐,使病毒失活。因此,该酶具有抗菌、消炎、抗病毒等作用。 该酶广泛存在于人体多种组织中,鸟类和家禽的蛋清、哺乳动物的泪、唾液、血浆、尿、乳汁等体液以及微生物中也含此酶,其中以蛋清含量最为丰富。从鸡蛋清中提取分离的溶菌酶是由18种129个氨基酸残基构成的单一肽链。它富含碱性氨基酸,有4对二硫键维持酶构型,是一种碱性蛋白质,其N端为赖氨酸,C端为亮氨酸。可分解溶壁微球菌、巨大芽孢杆菌、黄色八叠球菌等革兰阳性菌。 溶菌酶的应用过程中的优点 (1)溶菌酶是很稳定的蛋白质,有较强的抗热性。蛋清溶菌酶是C型,是已知的最耐热的酶; (2)溶菌酶不会因为有机溶剂的处理而失活,当转移到水溶液中时,溶菌酶的活力可全部恢复; (3)溶菌酶可被冷冻或干燥处理,且活力稳定; (4)溶菌酶适宜pH5.3~6.4,可用于低酸性食品防腐; (5)溶菌酶生产成本较低; (6)溶菌酶的抗菌谱较广,不仅局限于G+ 菌,对部分G 菌也有抑制效果; (7)溶菌酶作为防腐剂安全性高。溶菌酶是一种天然蛋白质,1992年FAO/WTO 的食品添加剂协会已经认定溶菌酶在食品中应用是安全的。 溶菌酶的应用 1 医学上应用 可作为一种具有杀菌作用的天然抗感染物质。有抗菌、抗病毒、止血、消肿止痛及加快组织恢复功能等作用。临床用于慢性鼻炎、急慢性咽喉炎、口腔溃疡、水痘、带状疱疹和扁平疣等。也可与抗菌药物合用治疗各种细菌和病毒感染。口服和肌注均有效。口服,3~5片/次(肠溶片含10mg),3次/日。口含,1片/次(口含片含20mg),4~6次/日。外用:以1%~2%溶液滴注、涂擦或直接喷粉。肌注,50mg~100mg/次,1~2次/日。滴眼:用2%溶液。 副作用 偶有较轻的过敏反应。氯化溶菌酶医疗效果更广,有浓痰分散、出血抑制、组织修复、消炎镇痛、抗过滤性病毒等作用,因而用氯化溶菌酶的制药有消炎消痔、治感冒、皮肤病及眼、鼻、喉等用药. 2食品保藏应用 可作为防腐剂,它的主要功用是水解细菌细胞壁,在细胞内,则对吞噬后的病原菌起破坏作用.该酶对革兰氏阳性菌中的枯草杆菌、耐辐射微球菌有分解作用。对大肠杆菌、普通变形菌和副溶血性弧菌等革兰氏阴性菌也有一定程度溶解作用,其最有效浓度为0.05%。与植酸、聚合磷酸盐、甘氨酸等配合使用,可提高其防腐效果。参考资料: http://ke..com/view/39726.htm

Ⅵ 溶菌酶是从哪儿提取出来的

溶菌酶广泛存在于鸟类、 家禽的蛋清中和哺乳动物的泪液、 唾液、 血浆、 乳汁、 胎盘以及体液、 组织细胞内,其中在蛋清中含量最丰富 (约 0.3% )。在一些植物体如卷心菜、 萝卜、无花果和微生物体内也存在溶菌酶,只是含量差异较大。
现在还没有看到可以从玉米中提取处溶菌酶的文献,最常用的提取原料还是鸡蛋清

Ⅶ 质粒的提取原理

质粒提取是指去除 RNA,将质粒与细菌基因组 DNA分开,去除蛋白质及其它杂质,以得到相对纯净的质粒。

目录

一、质粒提取原理

质粒是细胞内的一种环状的小分子DNA,是进行DNA重组的常用载体。作为一个具有自身复制起点的复制单位独立于细胞的主染色体之外,质粒DNA上携带了部分的基因信息,经过基因表达后使其宿主细胞表现相应的性状。在DNA重组中,质粒或经过改造后的质粒载体可通过连接外源基因构成重组体。

从宿主细胞中提取质粒DNA,是DNA重组技术中最基础的实验技能。分离质粒DNA有三个步骤:培养细菌使质粒扩增,收集和裂解细菌,分离和纯化质粒DNA。

在质粒提取过程中,由于机械力、酸碱度、试剂等的原因,可能使质粒DNA链发生断裂。所以,多数质粒粗提取物中含有三种构型的质粒:共价闭合环状DNA(cccDNA): 质粒的两条链没有断裂;超螺旋开环DNA(ocDNA): 质粒的一条链断裂;松弛的环状分子线形DNA(lDNA): 质粒的两条链均断裂;线性分子质粒DNA的分子构型 。

质粒DNA琼脂塘凝胶电泳模式图可分为:松弛线性的DNA; 松弛开环的OC构型; 超螺旋的SC构型。由于琼脂糖中加有嵌入型染料溴化乙锭,因此,在紫外线照射下DNA电泳带成橘黄色。 道中的SC DNA走在最前沿,OC DNA则位于凝胶的最后边;道中的L DNA 是经核酸内切限制酶切割质粒之后产生的,它在凝胶中的位置介于OC DNA 和 SC DNA 之间。

二、质粒提取方法

质粒DNA的提取方法主要有碱裂解法、煮沸法、酚氯仿裂解法。跟据不同的实验目的和仪器设备择取不同的实验方案。

(一) 碱裂解法:

此方法适用于小量质粒DNA的提取,提取的质粒DNA可直接用于酶切、PCR扩增、银染序列分析。方法如下:

1. 接1%含质粒的大肠杆菌细胞于2ml LB培养基。

2. 37℃振荡培养过夜。

3. 取1.5ml菌体于Ep管,以4000rpm离心3min,弃上清液。

4. 加0.lml溶液I(1%葡萄糖,50mM/L EDTA pH8.0,25mM/L Tris-HCl pH8.0)充分混合。

5. 加入0.2ml溶液 II(0.2 mM/L NaOH,1% SDS),轻轻翻转混匀,置于冰浴5 min 。

6. 加入0.15m1预冷溶液III(5 mol/L KAc,pH4.8),轻轻翻转混匀,置于冰浴5 min 。

7. 以10,000rpm离心20min,取上清液于另一新Ep管

8. 加入等体积的异戊醇,混匀后于0℃静置10min。

9. 再以10,000rpm离心20min,弃上清。

10. 用70%乙醇0.5ml洗涤一次,抽干所有液体。

11. 待沉淀干燥后,溶于0.05mlTE缓冲液中

(二) 煮沸法:

1. 将1.5ml培养液倒入eppendorf管中,4℃下12000g离心30秒。

2. 弃上清,将管倒置于卫生纸上几分钟,使液体流尽。

3. 将菌体沉淀悬浮于120ml STET溶液中,涡旋混匀。

4. 加入10ml新配制的溶菌酶溶液(10mg/ml), 涡旋振荡3秒钟。

5. 将eppendorf管放入沸水浴中,50秒后立即取出。

6. 用微量离心机4℃下12000g离心10分钟。

7. 用无菌牙签从eppendorf管中去除细菌碎片。

8. 取20ml进行电泳检查。

(三) 酚氯仿裂解法:

1. 从琼脂平板上挑取转化菌阳性克隆,接种到标准LB培养液中(含有卡那霉素30 μg/mL)摇菌12 h;收集1.5 mL菌液,8000 g/min离心3 min,弃上清,沉淀加入200 μL TE,充分混匀;加入400 μL酚氯仿(1∶1体积)混合液,剧烈振动10 s,混匀;12 000 g/min离心5 min,1 mL胰岛素注射针收集上清,尽量避免吸入蛋白沉淀层;上清经国产0。22 μm针式滤器过滤1次;向过滤上清液内加入2倍体积无水乙醇,振荡10 s,12 000 g/min离心5 min;沉淀溶于20 μL的RTE溶液中,37℃水浴。

2. 按PstI内切酶说明书进行酶切反应(37℃,1 h)。 酶切产物10 μL,10 g/L琼脂糖凝胶电泳。

3. PCR引物根据参考文献〔1〕设计,预计扩增产物片断大小为714 bp。

4. 常规制备感受态菌E。coli DH5a,提取质粒DNA常规转化感受态,涂于含有卡那霉素(30 μ/mL)LB培养平板中,37℃培养,15 h后观察筛选克隆情况。

三、质粒提取常见问题

(一) 溶液I—溶菌液:

溶菌酶:它是糖苷水解酶,能水解菌体细胞壁的主要化学成分肽聚糖中的β-1,4糖苷键,因而具有溶菌的作用。当溶液中pH小于8时,溶菌酶作用受到抑制。

葡萄糖:增加溶液的粘度,维持渗透压,防止DNA受机械剪切力作用而降解。

EDTA:1. 螯合Mg2+、Ca2+等金属离子,抑制脱氧核糖核酸酶对DNA的降解作用(DNase作用时需要一定的金属离子作辅基);2. EDTA的存在,有利于溶菌酶的作用,因为溶菌酶的反应要求有较低的离子强度的环境。

(二) 溶液II-NaOH-SDS液:

NaOH:核酸在pH大于5,小于9的溶液中,是稳定的。但当pH>12或pH<3时,就会引起双链之间氢键的解离而变性。在溶液II中的NaOH浓度为0.2mo1/L,加抽提液时,该系统的pH就高达12.6,因而促使染色体DNA与质粒DNA的变性。

SDS:SDS是离子型表面活性剂。它主要功能有:1. 溶解细胞膜上的脂质与蛋白,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜。2. 解聚细胞中的核蛋白。3. SDS能与蛋白质结合成为R-O-SO3-…R+-蛋白质的复合物,使蛋白质变性而沉淀下来。但是SDS能抑制核糖核酸酶的作用,所以在以后的提取过程中,必须把它去除干净,防止在下一步操作中(用RNase去除RNA时)受到干扰。

(三) 溶液III--3mol/L NaAc(pH4.8)溶液:

NaAc的水溶液呈碱性,为了调节pH至4.8,必须加入大量的冰醋酸。所以该溶液实际上是NaAc-HAc的缓冲液。用pH4.8的NaAc溶液是为了把pH12.6的抽提液,调回pH至中性,使变性的质粒DNA能够复性,并能稳定存在。而高盐的3mol/L NaAc有利于变性的大分子染色体DNA、RNA以及SDS-蛋白复合物凝聚而沉淀之。前者是因为中和核酸上的电荷,减少相斥力而互相聚合,后者是因为钠盐与SDS-蛋白复合物作用后,能形成较小的钠盐形式复合物,使沉淀更完全。

(四) 为什么用无水乙醇沉淀DNA?

用无水乙醇沉淀DNA,这是实验中最常用的沉淀DNA的方法。乙醇的优点是可以任意比和水相混溶,乙醇与核酸不会起任何化学反应,对DNA很安全,因此是理想的沉淀剂。

DNA溶液是DNA以水合状态稳定存在,当加入乙醇时,乙醇会夺去DNA周围的水分子,使DNA失水而易于聚合。一般实验中,是加2倍体积的无水乙醇与DNA相混合,其乙醇的最终含量占67%左右。因而也可改用95%乙醇来替代无水乙醇(因为无水乙醇的价格远远比95%乙醇昂贵)。但是加95%的乙醇使总体积增大,而DNA在溶液中有一定程度的溶解,因而DNA损失也增大,尤其用多次乙醇沉淀时,就会影响收得率。折中的做法是初次沉淀DNA时可用95%乙醇代替无水乙酵,最后的沉淀步骤要使用无水乙醇。也可以用0.6倍体积的异丙醇选择性沉淀DNA。一般在室温下放置15-30分钟即可。

(五) 在用乙醇沉淀DNA时,为什么一定要加NaAc或NaCl至最终浓度达0.1~0.25mol/L?

在pH为8左右的溶液中,DNA分子是带负电荷的,加一定浓度的NaAc或NaCl,使Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,易于互相聚合而形成DNA钠盐沉淀,当加入的盐溶液浓度太低时,只有部分DNA形成DNA钠盐而聚合,这样就造成DNA沉淀不完全,当加入的盐溶液浓度太高时,其效果也不好。在沉淀的DNA中,由于过多的盐杂质存在,影响DNA的酶切等反应,必须要进行洗涤或重沉淀。

(六) 加核糖核酸酶降解核糖核酸后,为什么再要用SDS与KAc来处理?

加进去的RNase本身是一种蛋白质,为了纯化DNA,又必须去除之,加SDS可使它们成为SDS-蛋白复合物沉淀,再加KAc使这些复合物转变为溶解度更小的钾盐形式的SDS-蛋白质复合物,使沉淀更加完全。也可用饱和酚、氯仿抽提再沉淀,去除RNase。在溶液中,有人以KAc代替NaAc,也可以收到较好效果。

(七) 为什么在保存或抽提DNA过程中,一般采用TE缓冲液?

在基因操作实验中,选择缓冲液的主要原则是考虑DNA的稳定性及缓冲液成分不产生干扰作用。磷酸盐缓冲系统(pKa=7.2)和硼酸系统(pKa=9.24)等虽然也都符合细胞内环境的生理范围(pH),可作DNA的保存液,但在转化实验时,磷酸根离子的种类及数量将与Ca2+产生Ca3(PO4)2沉淀;在DNA反应时,不同的酶对辅助因子的种类及数量要求不同,有的要求高离子浓度,有的则要求低盐浓度,采用Tris-HCl(pKa=8.0)的缓冲系统,由于缓冲液是TrisH+/Tris,不存在金属离子的干扰作用,故在提取或保存DNA时,大都采用Tris-HCl系统,而TE缓冲液中的EDTA更能稳定DNA的活性。

(八) 如何选择聚乙二醇(6000)的浓度来沉淀DNA?

采用PEG(6000)沉淀DNA,大小不同的DNA分子所用的PEG的浓度也不同,PEG的浓度低,选择性沉淀DNA分子量大,大分子所需PEG的浓度只需1%左右,小分子所需PEG浓度高达20%。本实验选择性沉淀4.3kb的pBR322质粒DNA,每毫升加入0.4毫升的30% PEG,其最终PEG浓度为12%。PEG选择性沉淀DNA的分辨率大约100bp。

(九) 抽提DNA去除蛋白质时,怎样使用酚与氯仿较好?

酞与氯仿是非极性分子,水是极性分子,当蛋白水溶液与酚或氯仿混合时,蛋白质分子之间的水分子就被酚或氯仿挤去,使蛋白失去水合状态而变性。经过离心,变性蛋白质的密度比水的密度为大,因而与水相分离,沉淀在水相下面,从而与溶解在水相中的DNA分开。而酚与氯仿有机溶剂比重更大,保留在最下层。

作为表面变性的酚与氯仿,在去除蛋白质的作用中,各有利弊,酚的变性作用大,但酚与水相有一定程度的互溶,大约10%~15%的水溶解在酚相中,因而损失了这部分水相中的DNA,而氯仿的变性作用不如酚效果好,但氯仿与水不相混溶,不会带走DNA。所以在抽提过程中,混合使用酚与氯仿效果最好。经酚第一次抽提后的水相中有残留的酚,由于酚与氯仿是互溶的,可用氯仿第二次变性蛋白质,此时一起将酚带走。也可以在第二次抽提时,将酚与氯仿混合(1:1)使用。

(十) 为什么用酚与氯仿抽提DNA时,还要加少量的异戊酵?

在抽提DNA时,为了混合均匀,必须剧烈振荡容器数次,这时在混合液内易产生气泡,气泡会阻止相互间的充分作用。加入异戊醇能降低分子表面张力,所以能减少抽提过程中的泡沫产生。一般采用氯仿与异戊酵为24:1之比。也可采用酚、氯仿与异戊醇之比为25:24:1(不必先配制,可在临用前把一份酚加一份24:1的氯仿与异戊醇即成),同时异戊醇有助于分相,使离心后的上层水相,中层变性蛋白相以及下层有机溶剂相维持稳定。

(十一) 为什么要用pH8的Tris水溶液饱和酚?呈粉红色的酚可否使用?如何保存酚不被空气氧化?

因为酚与水有一定的互溶,苯酚用水饱和的目的是使其抽提DNA过程中,不致吸收样品中含有DNA的水分,减少DNA的损失。用Tris调节至pH为8是因为DNA在此条件下比较稳定。在中性或碱性条件下(pH5~7),RNA比DNA更容易游离到水相,所以可获得RNA含量较少的DNA样品。

保存在冰箱中的酚,容易被空气氧化而变成粉红色的,这样的酚容易降解DNA,一般不可以便用。为了防止酚的氧化,可加入疏基乙醇和8-羟基喹琳至终浓度为0.1%。8-羟基喹琳是带有淡黄色的固体粉末,不仅能抗氧化,并在一定程度上能抑制DNase的活性,它是金属离子的弱螯合剂。用Tris pH8.0水溶液饱和后的酚,最好分装在棕色小试剂瓶里,上面盖一层Tris水溶液或TE缓冲液,隔绝空气,以装满盖紧盖子为宜,如有可能,可充氮气,防止与空气接触而被氧化。平时保存在4℃或-20℃冰箱中,使用时,打开盖子吸取后迅速加盖,这样可使酚不变质,可用数月。

(十二) 未提出质粒或质粒得率较低?

1. 大肠杆菌老化

请涂布平板培养后,重新挑选新菌落进行液体培养。

2. 质粒拷贝数低

由于低使用低拷贝数载体引起的质粒DNA提取量低,可更换具有相同功能的高拷

贝数载体。

3. 菌体中无质粒

有些质粒本身不能在某些菌种中稳定存在,经多次转接后有可能造成质粒丢失。

例如,柯斯质粒在大肠杆菌中长期保存不稳定,因此不要频繁转接,每次接种时

应接种单菌落。另外,检查筛选用抗生素使用浓度是否正确。

4. 碱裂解不充分

使用过多菌体培养液,会导致菌体裂解不充分,可减少菌体用量或增加溶液P1、

P2和P3的用量。对低拷贝数质粒,提取时,可加倍使用溶液P1、P2和P3,可能

有助于增加质粒提取量和质粒质量。

5. 溶液使用不当

溶液P2、P3在温度较低时可能出现浑浊,应置于37℃保温片刻直至溶解为清亮的

溶液,才能使用。

6. 吸附柱过载

不同产品中吸附柱吸附能力不同,如果需要提取的质粒量很大,请分多次提取。若

用富集培养基,例如TB 或2×YT,菌液体积必须减少;若质粒或宿主菌是非常高

的拷贝数或生长率,则需调整LB培养液体积。

7. 质粒未全部溶解(尤其质粒较大时)

洗脱溶解质粒时,可适当加温或延长溶解时间。

8. 乙醇残留

漂洗液洗涤后应离心尽量去除残留液体,树脂型试剂盒漂洗后应晾干树脂,再加

入洗脱缓冲液。

9. 洗脱液加入位置不正确

洗脱液应加在硅胶膜中心部位以确保洗脱液会完全覆盖硅胶膜的表面达到最大洗脱

效率。

10. 洗脱液不合适

DNA只在低盐溶液中才能被洗脱,如洗脱缓冲液EB (10 mM Tris?Cl, pH 8.5)

或水。洗脱效率取决于pH值。最大洗脱效率在pH7.0-8.5间。当用水洗脱时确保

其pH值在此范围内,如果pH过低可能导致洗脱量低。洗脱时将灭菌蒸馏水或洗脱

缓冲液加热至60℃后使用有利于提高洗脱效率。

11. 洗脱体积太小

洗脱体积对回收率有一定影响。随着洗脱体积的增大回收率增高,但产品浓度降

低。为了得到较高的回收率可以增大洗脱体积。

12. 洗脱时间过短

洗脱时间对回收率也会有一定影响。洗脱时放置一分钟可达到较好的效果。

(十三) 质粒纯度不高?

1. 混有蛋白

不要使用过多菌体。溶液P1、P2、P3处理并离心后溶液应为澄清的,如果还混有

微小蛋白悬浮物,可再次离心去除后再进行下一步骤。

2. 混有RNA

RNase A处理不彻底,请减少菌体用量或加入溶液P3之后室温放置一段时间。如

果溶液P1已保存6个月以上,请在溶液P1中添加RNase A。

3. 混有基因组DNA

加入溶液P2和P3后应温和混匀,如果剧烈振荡,可能把基因组DNA剪切成碎片从

而混杂在质粒中。如果加入溶液P2后过于粘稠,无法温和混匀,请减少菌体用

量。细菌培养时间过长会导致细胞和DNA的降解,不要超过16 小时。

4. P3溶液加入时间过长

P3溶液加入后,放置时间不要太长,否则有可能会产生小片段DNA污染。

5. 含大量核酸酶的宿主菌

宿主菌含大量核酸酶,在质粒提取过程中降解质粒DNA,影响提取质粒DNA的完

整性,最好选用不含核酸酶的大肠杆菌宿主菌,如DH5α和Top10。

6. 裂解时间过长

加入溶液P2后裂解时间不应超过5分钟。

7. 质粒的二聚体和多聚体形式

质粒复制过程中形成的,与宿主菌相关,电泳可检测出。

Ⅷ 停止溶菌酶酶解处理需要加什么呢

溶菌酶既然是蛋白质,过高的pH和低于8的pH下都会被抑制,强离子浓度时也会被抑制,加热或者加入SDS也会失活.
在提取质粒过程中,对于难以裂解的细胞会加入溶菌酶,但这一步一定要先加,然后再加P2裂解,因为P2里面的SDS等会使溶菌酶失活.

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